Illumina GA IIx新一代高通量测序服务上海康成生物工程有限公司

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技术服务信息

服务名称:Illumina GA IIx新一代高通量测序服务
服务类别:分子生物学服务 - 第二代高通量测序
价格:询价
允许参观:不允许参与实验
所在区域:上海.上海
更新时间:2017/12/20 11:38:00
浏览人数:13723
诚信指数:966点
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使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海康成生物工程有限公司
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技术服务详细描述

Illumina GA IIx新一代高通量测序服务

 

    为了适应广大研究者更加深入的研究需求,康成生物特别推出基于Illumina Genome Analyzer IIx测序系统的新一代高通量测序服务。

    Genome Analyzer IIx系统能够同时对数亿的序列进行测序,极大的扩展了基因组学,转录组学以及表观遗传组学等领域的研究分析能力,目前已广泛地应用于DNA测序,基因调控分析,转录组分析,SNP发现以及结构变异分析,细胞遗传学分析,DNA-蛋白相互作用分析(ChIP-Seq),甲基化分析,小RNA发现和分析等诸多领域。运用新一代GA IIx系统,我们能为您在最短时间内获得最多的高质量数据,轻松完成开创性的工作,同时减少项目的时间和成本。

 

技术特点
* 超高通量:
同时对上亿条序列进行测序,每次实验能产生数十亿的碱基信息。
* 高灵敏度:能够检测到丰度极低的序列以及测序微量的珍贵样品。
* 高精确率:自动化的测序流程和数据处理保证了测序数据的精确性。
* 广泛的应用领域:能够灵活地应用于基因组学,转录组学以及表观遗传组学研究

 

技术原理

    基于Genome Analyzer IIx系统的高通量测序技术首先是将样品DNA打断成合适的大小(约100~200bp),两端连接上特定的DNA接头,使用PCR扩增后制成测序文库。随后使其利用碱基互补原理随机结合到含有接头的flow cell上,利用桥式PCR(Bridge PCR)反应获得上亿条成簇分布的待测序列。最后使用Illumina特有的边合成边测序技术(Sequencing By Synthesis),在DNA聚合酶和荧光标记的dNTP作用下,随着每一轮测序引物延伸,相应结合到延伸链的荧光标记dNTP被激发释放出荧光信号,测序仪通过捕获相应位置的荧光信号,并转换获得该位置待测片段的序列信息。整个测序过程完全由计算机自动化处理完成,能够在极短时间内获得数十亿高精确度的碱基序列信息,是目前实用性最强的新一代测序技术。
    康成生物提供基于Illumina Genome Analyzer IIx测序系统的高通量测序服务项目,为基因组,转录组以及表观遗传组等研究领域的广大研究人员提供更深入,更全面的技术服务:

microRNA测序服务

能够直接对样本中指定大小的所有microRNA分子进行高通量测序,在无需任何序列信息的前提下研究microRNA的表达并在此基础上发现和鉴定新的microRNA分子,并提供了更加灵活和深入的分析和研究方法。


DNA甲基化测序服务    
    基于Illumina高通量测序平台的DNA甲基化测序能够获得全基因组范围内高精度的甲基化状态,不受物种和基因组区域的限制,是全面且深入理解表观遗传调控最好的研究手段。
  

DNA羟甲基化测序服务

       DNA羟甲基化是一种重要的表观遗传修饰,对基因的表达起调控作用,在神经分化和癌症中发挥重要的作用。为深入了解5hmC的作用,我们就必须清楚5hmC在基因组的分布情况。然而,传统的基于重亚硫酸盐的方法无法区分5-hmC和5-mc。5-hmC单克隆抗体捕获法是研究DNA羟基化修饰的利器,结合高通量测序技术以及生物信息分析,可以获得全基因组羟甲基化分布图,从而能帮助我们从一个新的角度来解析胚胎发育,神经细胞分化以及癌症发生的分子机制。

RRMHS(Reduced Representation Methylcytosine & Hydroxymethylcytosine Sequencing)测序服务

康成生物RRMHS(Reduced Representation Methylcytosine & Hydroxymethylcytosine Sequencing)由传统的RRBS方法改进而来。通过采用双酶切消化,能够检测比传统RRBS方法更多的甲基化CpG位点以及更广的基因组区域。此外,通过创新性的引入糖基化修饰,可以在检测甲基化CpG位点的同时,平行检测全基因组范围内MspI酶切位点(CCGG)中羟基化的CpG。从而使客户能够获得全基因组范围内单碱基分辨的甲基化/羟甲基化分布,为深入的表观遗传调控分析提供了更有利的切入点。

染色质免疫共沉淀测序服务
    ChIP-Sequencing技术能够在全基因组水平更精确,更灵敏的检测组蛋白各种共价修饰、CTCF、RNA聚合酶II以及各种转录因子等DNA结合蛋白在基因组上的精确结合位点,为表观遗传组学与基因转录调控机制提供了更加有力的分析手段。


转录组测序服务
    能够在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能够发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及cSNP(编码序列单核苷酸多态性),提供最全面的转录组信息。

人体微生物组测序服务

    人体的微生物群落构成,称之为人体微生物组(Human Microbiome),其改变能够大幅影响人体的各项生理活动,包括代谢及药物作用等,与多种疾病的发生存在关联。
     传统的微生物群落分析方法(如分离纯培养,单克隆测序等)操作繁琐、成本高,且不能检测痕量微生物,随着高通量测序技术的应用,这些问题都迎刃而解。康成服务为您同时提供现有的两种高通量微生物群落测序分析方法:16s rDNA测序和鸟枪法宏基因组测序。通过这两种方法,可以:1. 准确定量分析不同人体来源如皮肤、内脏、血液、肠道等样本的微生物组;2. 比较不同样本间的微生物组差异;3. 研究微生物组差异与人体生理活动及疾病的关系;4. 寻找疾病诊断的生物标记和药物开发的靶标。
 
一、16s rDNA测序服务
    细菌编码16s rRNA的rDNA基因具有良好的进化保守性以及与进化距离相匹配的良好变异性。
16s rDNA测序服务采用通用引物对细菌群落的16s rDNA含有的可变区域进行PCR扩增,然后高通量测序,通过对16s rDNA可变区序列的比对分析,可以准确定量分析不同样本细菌群落的构成,研究人体微生物组。
  
二、鸟枪法宏基因组测序服务
    微生物进化变异体现在全基因组范围的DNA序列上。鸟枪法宏基因组测序直接对微生物群落的混合基因组DNA样本进行高通量测序,通过全基因组范围分类标记DNA序列的比对分析,可以准确定量分析不同样本微生物群落的构成,研究人体微生物组。

 

 

 

上海康成生物工程有限公司
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网址:www.kangchen.com.cn

 

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