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lncRNA测序上海欧易生物医学科技有限公司

技术服务信息

服务名称:lncRNA测序
服务类别:分子生物学服务 - 第二代高通量测序
价格:询价
允许参观:允许参观
所在区域:上海.上海
更新时间:2016/9/26 10:34:00
浏览人数:3641
诚信指数:282点
了解更多:进入公司展台
使用范围:仅限科研使用,不能应用于临床
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上海欧易生物医学科技有限公司
地址:
上海市闵行区浦江镇新骏环路138号2幢4楼
邮编:
201114
电话:
4006400826
传真:
021-34781616
联系人:
郑云娜
所在区域:
上海·上海
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技术服务详细描述

lncRNA测序

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA。利用新一代高通量测序技术进行lncRNA测序,并结合生物信息学的预测工具进行lncRNA分析,有助于科研工作者更快发现那些具有重要调控功能的lncRNA,分析其与特定生物学过程的关系。该方法可以更加高效地获取lncRNA序列以及位置信息,且突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制,还可对新的lncRNA进行预测及功能分析,极大促进lncRNA的深入研究。

欧易特色

● 技术稳定,建库重复性好:同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993

● 高特异性:使用特定方法降低样本中rRNA的丰度

● 高准确度:构建链特异性转录组文库,快速、高效、准确地获取样本中几乎全部的lncRNA序列及其位置信息

● 分析严格:系统鉴定已知lncRNA,设置严格的筛选条件用于发现新的lncRNA

● 独具特色的lncRNA高级分析:lncRNA cis和trans调控机制以及ceRNA调控机制等

● 经验丰富:已对多种动植物的lncRNA进行测序分析

项目流程

获取total RNA---去除rRNA---链特异性---文库构建---上机测序---原始测序数据---数据质控---数据分析

推荐测序模式

● Hiseq4000, PE150 ● 一般测序:10 Gb/样本 ● 深度测序:20 Gb/样本

数据分析内容

标准数据分析

● 原始测序数据质控 ● 测序数据质量评估

● Reads污染检测 ● 参考基因组比对

● 转录本重建/组装分析 ● 潜在长链非编码RNA挖掘

● 长链非编码RNA特征分析 ● lncRNA表达量分析

● 差异表达分析

高级数据分析

● lncRNA-mRNA共表达分析

● lncRNA cis、trans分析

● ceRNA分析

● WGCNA分析

样品要求

● Total RNA:≥2 μg ● OD260/280为1.8-2.2

● 适用范围:有参考基因组物

了解更多转录组研究,请登录www.oebiotech.com

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