蛋白质相互作用网络分析
蛋白质相互作用网络中信号流向方向预测;根据网络的拓扑性质,挖掘网络重要节点(如hub节点,crosstalk节点);根据功能信息注释,进行网络模块化
绝对定量蛋白质组学(MRM)
利用MRM技术与同位素稀释相结合,通过对比已知浓度的标记标准品与待测样子目标离峰面积信息,从而推算分析物含量。具有灵敏度高、重现性好、准确度高和通量高等技术优势。
单一蛋白的高覆盖度分析
iTRAQ/TMT蛋白组定量分析 SILAC蛋白组定量分析 Label Free非标定量分析 半定量分析(spectral count) 鸟枪法蛋白全谱分析 2D蛋白胶点鉴定 单一蛋白高覆盖度分析
磷酸化蛋白质鉴定和定量
对样本进行酶解,TiO2或IMAC富集磷酸化肽段,5600-plus质谱检测,利用得到的质谱谱图与数据库搜索比较,从而得到肽段序列结果,计算出磷酸化位点。磷酸化蛋白选择iTRAQ定量或SWATH定量