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201501祝贺联川生物客户于Nature发表重要研究成果！

         在最近十余年的生命科学研究中，对具有重要调控功能的非编码RNA的研究是最引人关注的领域之一，而长链非编码RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）一经登场，便迅速成为非编码RNA界又一颗耀眼的明星。lncRNAs是一类长度大于200nt的非编码RNA，广泛存在于各种生物体内，在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控，与动植物的生长发育，人类的疾病发生有着密切关系，也可作为疾病诊断的标志物或是治疗的重要靶点。联川生物推出的lncRNA测序服务，将高通量测序技术与最新的生物信息分析策略相结合，助您轻松跨入lncRNA研究时代。

◆ 文库优化：采用核糖体去除和链特异性文库构建方案，保留了完整的lncRNA和mRNA序列，以及序列方向性。

◆ 序列完整：对样本中几乎全部的lncRNA和mRNA序列进行鉴定和分析。

◆ 物种多元：对包括人类、动植物在内的许多物种的lncRNA进行鉴定和分析。

◆ 分析严谨：系统收集lncRNA数据库用于鉴定已知lncRNA，并设置严格的筛选条件用于发现新lncRNA。

◆ 关联全面：开展lncRNA与mRNA的关联分析，深入分析lncRNA调控网络。 

案例一：利用测序技术研究lncRNA对食管癌增殖与转移的调控作用¹

　　lncRNA在人类疾病的发生与发展中具有极其重要的作用。某些lncRNA的失调直接涉及人类癌症的发生。本研究采用高通量测序技术，对食管腺癌组织和配对的正常组织中的lncRNA进行鉴定和差异表达分析。实验共发现6216个lncRNAs在食管腺癌组织中表达，其中lncRNA HNF1A-AS1显著过表达。敲除HNF1A-AS1能抑制食管腺癌细胞的增殖与转移，并抑制癌症相关lncRNA H19的表达。结果表明，HNF1A-AS1的失调参与了食管癌的发生，而该参与过程有可能部分受到染色质与核小体组装的改变及H19诱导的调节。上调的HNF1A-AS1有望成为诊断具有高浸润性或是转移性食管癌的新生物标志物。  

图1   敲减HNF1A-AS1会抑制食管腺癌细胞增殖和侵袭

案例二：利用测序技术鉴定斑马鱼胚胎发育过程中的lncRNA组²

      lncRNA在脊椎动物胚胎发育过程中的表达谱及其潜在作用目前仍然报道较少。本研究以早期发育的斑马鱼为模型，采用链特异性转录组测序技术分析了其胚胎发育过程中的lncRNA表达谱。实验共鉴定出56,535个高置信度的编码转录本，并严谨的定义了1,133个非编码转录本，包括lincRNAs，内含子重叠lncRNAs, , , , ，外显子反义链重叠lncRNAs，以及小RNA前体。实验发现，斑马鱼lncRNA共享了哺乳动物lncRNA的许多特征，如长度较短，表达水平较低等。lncRNA时序表达谱分析揭示2个新特征：lncRNA相比mRNA表达的时间窗更窄，并且在胚胎早期富集。生物信息分析表明，lncRNA与从细胞周期调控到形态发生等特定的通路和功能相关。

图1   测序分析斑马鱼胚胎发育阶段转录组的流程

1、Yang X, Song JH, Cheng Y, et  al. Long non-coding RNA HNF1A-AS1 regulates proliferation and migration in oesophageal adenocarcinoma cells. Gut. 2014, 63(6):881-90.

2、Pauli A, Valen E, Lin MF, et al. Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis. Genome Res. 2012 Mar;22(3):577-91.  

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