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DNA甲基化测序(WGBS/MeDIP-Seq/RRBS)

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产品名称: DNA甲基化测序(WGBS/MeDIP-Seq/RRBS)

英文名称: Methylated DNA sequencing

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       DNA甲基化是表观遗传学的热点研究领域,在调控基因转录、传递基因组印记、维持染色质结构、调控胚胎发育以及肿瘤等疾病发生中发挥关键作用。获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据,对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。我们以高通量测序平台为基础,在全基因组水平,采用多种测序技术帮助用户绘制详尽的DNA甲基化图谱。联川生物为用户提供全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS),甲基化DNA免疫共沉淀测序(MeDIP-Seq),以及采用酶切方式的简化甲基化测序(RRBS)等多种甲基化分析手段,以满足用户不同的研究需求。  

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◆ 覆盖范围广:覆盖全基因组范围内的甲基化区域。

◆ 精确度高:采用WGBS和RRBS可达到单碱基分辨率,精确分析每一个C碱基的甲基化状态。

◆ 超精细分析:国内率先对甲基化发生区域进行精细定位,以促深入解析甲基化对功能的影响。

◆ 性价比高:相比于WGBS,采用MeDIP-Seq和RRBS可以直接对高甲基化区域进行分析,实验支出更经济。  

 

  

案例一:利用WGBS技术研究人类胚胎干细胞的分化调控机制1

      人类胚胎干细胞(hESCs)分化提供了一个研究细胞转换调控机制的独特机会。本研究采用了多种高通量测序技术,包括全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS),染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq),和转录组测序对分化自hESCs的细胞系进行表观与转录表达谱的分析。实验发现,DNA甲基化与细胞多能性密切相关。该研究也有助于发现现行干细胞技术的不足,研发出更准确可靠的分化策略。

1   定向分化中的表观遗传重塑是谱系特异的

案例二:利用WGBS技术深入解析玉米甲基化组2

  玉米基因组是研究表观遗传机制的理想模型。本研究使用WGBS并联合其他测序技术对2个玉米自交株系(B73和Mol7)进行全基因组的甲基化图谱分析。实验发现,转座子和重复序列的甲基化在自交系间是高度保守的,但是基因体的甲基化表现出更多变异。关联甲基化模式分析表明外显子的CG甲基化可能会阻止      转座子的插入,而剪接受体位点的CHG甲基化可能会抑制RNA剪接。研究人员以甲基化图谱为指导,采用低覆盖度测序,分析表明亲本甲基化差异可以遗传给重组自交系。  

1   玉米全基因组水平甲基化图谱  

 

1、Gifford CA, Ziller MJ, Gu H, et  al. Transcriptional and epigenetic dynamics during specification of human embryonic stem cells. Cell. 2013, 153(5):1149-63.

2、Regulski M, Lu Z, Kendall J, et  al. The maize methylome influences mRNA splice sites and reveals widespread paramutationlike switches guided by small RNA. Genome Res. 2013 Oct;23(10):1651-62.  

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